曾几何时，神秘生物奇居子入侵太阳系，致使人类流离失所，只能乘坐行星般大小的巨型飞船希德尼娅流浪在茫茫宇宙中。如是过了漫长的一千年，而今希德尼娅的居民们已有一百年未曾遭遇奇居子，不过他们从未放松警惕，培养了一代又一代操纵人形兵器“卫人”的驾驶员。某天，居住在地下的青年谷风长道（逢坂良太配音）迫于饥饿爬到地面，偷米后被人抓住，后在舰长（大原沙耶香配音）的授意下成为卫人驾驶员第628期的训练生，在这里他见到了有过一面之缘的善良女孩星白闲（洲崎绫配音）、友好的第三性人科户濑伊扎那（丰崎爱生配音）以及高傲刚愎的岐神海苔夫（樱井孝宏配音）等人。未几，少年们外出执行采集任务，甚至却遭逢百年不见的奇居子。沉寂已久的宇宙战争再度拉开帷幕……本片根据贰瓶勉的漫画原作改编。故事舞台设立在 太阳系被称为奇居子的谜之生命体破坏殆尽后的1000年后，在维持人类繁殖和生产、于宇宙中飞行的播种船希德尼娅上生活的主人公谷风长道成为了巨大人型兵器“卫人”的操纵士训练生，作品讲述的便是主人公与同伴们一起同奇居子战斗的故事。该作在过去作品相同的SF漫画类型的题材之上，融合了机器人、学园恋爱等要素，是一部构筑了自己独特世界观的战斗SF漫画 。